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大標本成像係統商家帶來光片顯微鏡技術小課堂——數據的處理

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大標本成像係統商家帶來光片顯微鏡技術小課堂——數據的處理

發布日期:2021-06-04 作者: 點擊:

大標本成像係統商家帶來光片顯微鏡技術小課堂——數據的處理

光片顯微鏡的一個顯著優點是能夠在數小時(或數天)內以非常高的時間與空間分辨率對大樣本進行成像,但由此導致的結果是會產生巨大的數據量,很容易達到TB級別,於是樣本成像的速度不再受圖像采集速度的限製,而是受數據處理電腦、存儲容量和數據傳輸速度的限製。

當以中等幀速成像時,相機采集的數據可以簡單地通過消費級市場標準的連接傳輸到采集電腦的存儲磁盤,甚至使用網絡連接傳輸到雲端的普通存儲電腦。如果使用速度更快的相機,數據傳輸速度將會成為限製。有些相機允許圖像數據流保存到內部存儲器,需要在采集後讀出;其他相機則選擇采用更快的數據連接,這在大多數情況下需要在計算機中安裝額外的硬件(圖像采集卡)。然後,數據流要麽傳輸到足夠大的主存儲器,要麽以同樣快的速度(避免數據丟失)傳輸到專用的數據存儲設備。

大標本成像係統.png

還有一種辦法則是通過圖像壓縮來降低數據量。圖像數據可以在相機、圖像采集卡、處理器(CPU)或圖形處理卡(GPU)中壓縮。這樣的確能直接減輕數據傳輸和存儲係統的壓力,但增加了對壓縮和隨後解壓縮的處理能力的需求。

解決數據量問題的一個更有效的選擇是在拍攝前預定義感興趣的區域(ROI),並僅存儲這些區域的數據。這種實時處理的方法一般是為特定的某個標本或科學問題定製的,但可以使圖像數據本身減少很多。同時,在處理過程中數據已經很好地被可視化,以便於進一步的數據分析。

本文網址:http://www.kyotou.cn/news/573.html

關鍵詞:大標本成像係統,標本成像,標本成像係統

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